gatk1 GATK Variant calling을 위해서 GATK를 사용해 보았다. 공식 : https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us 다운로드 : https://github.com/broadinstitute/gatk/releases $ wget https://github.com/broadinstitute/gatk/releases/download/4.1.8.1/gatk-4.1.8.1.zip $ unzip gatk-4.1.8.1.zip $ cd gatk-4.1.8.1 $ ./gatk 압축을 풀고 나서 설치과정 없이 바로 사용 가능하다. 준비과정으로 reference fasta file의 dictionary만드는 과정이 필요하다. $ samtools faidx hg37.fa # generate i.. 2020. 8. 7. 이전 1 다음
