tcga2 [R] TCGAbiobanks Reference - https://bioc.ism.ac.jp/packages/3.4/bioc/vignettes/TCGAbiolinks/inst/doc/tcgaBiolinks.html - https://rpubs.com/tiagochst/LUAD_DNA_methylation_data 2022. 3. 10. TCGA data https://portal.gdc.cancer.gov/repository TCGA 에서는 DNA와 RNA 데이터를 여러가지 형태로 제공한다. 다음의 순서로 원하는 데이터를 다운로드 받는다. 데이터 정보 ( aligned by GRCh38 ) : https://docs.gdc.cancer.gov/Encyclopedia/pages/RNA-Seq/ 1. 데이터 선택 : [ Files ] 탭에서 데이터 분류를 선택하고, [ Cases ] 탭에서 데이터 종류를 선택한다. 2. 그래프 위쪽 부분에 [ Manifest ] 버튼을 눌러 데이터 리스트를 다운로드 받는다. : gdc_manifest.2021-08-27.txt 3. 데이터 정보를 JSON 형태로 다운로드 받는다. : files.2021-08-27.json .. 2021. 8. 30. 이전 1 다음
