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temp 보호되어 있는 글 입니다. 2024. 7. 8.
github 명령어 사용 - LINUX에서 github와 연동하여 작업을 진행할때 필요한 명령어 git config --global user.name "username" git config --global user.email user@gmail.com git init # git 저장하거나 수정하는 폴더 지정. git remote add origin URL # Repository 등록 git remote -v # 연동 확인 git clone URL git pull origin # 현재 코드에 저장소 최신 파일들 merge git fetch origin # 저장소 파일들 가져오기 git add . or git add -A # 변경내용 저장 git commit -m "name of commit" # 변경내용 묶기 git commit .. 2023. 11. 13.
Retina image 보호되어 있는 글 입니다. 2023. 6. 4.
Sensitivity analysis Sensitivity analysis is a method used to understand the impact of uncertainty or variation in the input parameters or assumptions of a model on the output or results. It helps to quantify the degree to which changes in the input parameters affect the model's predictions, and to identify which input parameters have the most significant impact on the model's output. Sensitivity analysis is particu.. 2023. 3. 31.
2023 BOOKs 월 - 권. 제목 / 작가 / 내용 01 - 01. 통계 101×데이터 분석 / 아베 마사토 / 통계에 대해 쉽게 설명함. 02 - 02. 엔드오브타임 / 브라이언 그린 / 우주, 인간, 의식, 마음, 예술, 종교, 죽음, 모든 것을 다시 생각해보게 함. 03 - 03. 상실 / 조앤 디디온 / 남편을 떠나보내고 1년 동안의 생활와 과거의 회상을 세밀하게 표현함. 날마다 조금씩 더 사랑해. 03 - 04. 우리는 각자의 세계가 된다 / 데이비드 이글먼 / 뇌는 계속 발전하고 적응한다. 03 - 05. 향의 과학 / 히라야마 노리아키 / 샤넬 NO.5 가 무슨 향인지 알게되었다. 04 - 06. 클래식이 알고 싶다. 고전의 전당 편 / 안인모 / 비발디(1678-1741), 바흐(1685-1750), 헨델.. 2023. 2. 27.
English level https://oxfordhousebcn.com/en/levels/ 2023. 2. 26.
[Metabolism] Glycolysis Biochemistry https://youtube.com/playlist?list=PLTF9h-T1TcJhcNo9M1VFXz6rMKT6CM_wd - [Metabolism] Glycolysis, https://youtu.be/gggC9vctvBQ - [Metabolism] Regulation of Glycolysis, https://youtu.be/xoqyF6DJZ-Y - Exercise and Insulin Stimulated Glucose Uptake by Skeletal Muscle, https://youtu.be/9UVl4HQ2V1Q - Structure of the Cell Membrane, https://youtu.be/RT61MUjogRo 2023. 1. 23.
[SAS] Example 6 보호되어 있는 글 입니다. 2023. 1. 6.
Standard population 빅데이터를 분석할 경우, 나이를 고려하여 표준화 작업을 해주어야 하는 경우가 있다. 특히 다른 cohort나 연도 데이터들을 비교할 때, 나이에 따른 weight 를 곱하여 비교하여야 좀 더 정확한 결과를 얻을 수 있다. 이때 사용되는 weight를 정해 놓은 것이 standard population이고, 각 나이 구간의 crude rate에 곱하여 cohort의 motablity 를 구한다. The standard population data files contain the following data: - U.S. Standards (1940, 1950, 1960, 1970, 1980, 1990, 2000) - Canadian Standards (1991, 1996, 2011) - European (S.. 2022. 12. 27.
[SAS] Example 5 보호되어 있는 글 입니다. 2022. 12. 27.
[SAS] Example 4 보호되어 있는 글 입니다. 2022. 12. 25.
[SAS] Example 3 보호되어 있는 글 입니다. 2022. 12. 12.
[SAS] Example 2 보호되어 있는 글 입니다. 2022. 12. 12.
[SAS] Example 1 보호되어 있는 글 입니다. 2022. 12. 12.
Python 3.11 Python 3.11 is 1.25 times faster than Python 3.10. https://www.python.org/downloads/release/python-3110/ sudo add-apt-repository ppa:deadsnakes/ppa sudo apt update sudo apt install python3.11 sudo update-alternatives --install /usr/bin/python3 python3 /usr/bin/python3.10 110 sudo update-alternatives --install /usr/bin/python3 python3 /usr/bin/python3.11 100 sudo update-alternatives --config pyth.. 2022. 11. 11.
MariaDB 명령어 * 명령어는 소문자, 대문자 상관없다. 기본 명령어 SHOW DATABASES; CREATE DATABASE dbname; USE dbname; CREATE TABLE tablename (col1 int(10) col2 char(8)); DESC tablename; Table related, SHOW TABLES; SHOW TABLES LIKE '키워드%'; SHOW TABLES FROM 데이터베이스; SHOW TABLES FROM 데이터베이스 LIKE '키워드%'; SHOW INDEX FROM 테이블; SHOW TABLE STATUS; SHOW TABLE STATUS FROM 데이터베이스; SHOW CREATE TABLE 테이블; # 테이블 새이름으로 ALTER TABLE 테이블명 RENAME 새테이블.. 2022. 10. 25.
MariaDB setting Installation sudo apt update && sudo apt upgrade sudo apt -y install software-properties-common sudo apt-key adv --fetch-keys 'https://mariadb.org/mariadb_release_signing_key.asc' sudo add-apt-repository 'deb [arch=amd64] http://mariadb.mirror.globo.tech/repo/10.5/ubuntu focal main' sudo apt install mariadb-server mariadb-client -y ## if you meet some error about libssl1.1, then echo "deb http:/.. 2022. 10. 25.
바로가기 shell:AppsFolder 전원끄기: shutdown -s -t 0 화면스케치: ms-penworkspace://Capture PC화면만: displayswitch.exe /internal PC화면확장: displayswitch.exe /extend 화면잠금: C:\Windows\System32\rundll32.exe user32.dll, LockWorkStation shell:startup Sound Keeper https://veg.by/en/projects/soundkeeper/ Color Red #ff004f #EA4335 Blue #008bfb #4285F4 Orange #FBBC04 Green #34A853 SAS 현재 행 축소 선택 영역을 아래로 확장 모든 접힌 블록 확대 기능키 F9 z.. 2022. 10. 3.
Prevalence vs. Incidence Prevalence : 특정 시점 또는 특정 기간 동안 특정 모집단에서 발생한 질병 사례의 수. Incidence : 특정 기간 동안 특정 인구에서 새로운 질병 사례가 발생하는 비율 2022. 9. 28.
RR, OR, HR Relative risk는 case-control 사이의 비율을 나타낸다. Odds ratio 와 Hazard ratio 는 같은 수식을 값이 계산되며 강조하고 싶은 내용에 따라 선택적으로 쓰여진다. 95% confidence interval 은 다음과 같이 정의된다. Hazard ratio 역시 OR 계산 방법과 같다. P-value 를 구하는 방식은 Null hypothesis 로 OR=1 이라고 설정하고 계산하여, significant level을 0.05 로 두어 유의미한지 판단한다. 첫째로 standard error는 아래와 같고, Z 값은 다음과 같이 정의된다. P-value (two-sided) 는 2022. 9. 27.
[Excel] 하이퍼링크, 시트정렬 엑셀에서 URL 주소가 스트링으로 되어있을 때가 있다. 하이퍼링크로 만드는 방법은 다음과 같다. =hyperlink(URL주소, [표시할이름]) or = =hyperlink("#"&시트명&"!A1",[표시할이름]) 매크로를 사용하는 방법도 있다. [ Alt+F11 => Insert => Module ] Public Sub Convert2Hyperlinks() Dim Cell As Range For Each Cell In Intersect(Selection, ActiveSheet.UsedRange) If Cell "" Then ActiveSheet.Hyperlinks.Add Cell, Cell.Value End If Next End Sub 엑셀에서 영역을 선택한 후 VB 창에서 F5를 누르거나, [ Alt.. 2022. 9. 14.
[NEWS] 카티(CAR-T) 치료제 - 카티 치료제를 통해 암이 제거된 이미지가 나옴. https://youtu.be/iUjcEZ4LRLo - 이중 카티: 2가지 표적에 반응하도록 만듬. https://youtu.be/6N2sjJcR6Jk 2022. 8. 22.
pathlib in python 보호되어 있는 글 입니다. 2022. 8. 18.
[DB] SQL with python Python에서 db 파일을 불러오거나 생성하여 데이터를 처리해 보자. import sqlite3 con = sqlite3.connect('test.db') cur = con.cursor() sqlite3 패키지는 python3에 기본으로 내장되어 있다. 우선 DB에 접근하기 위해 파일을 연결시켜야 한다. cursor를 불러와 DB에 접근한다. cur.execute("CREATE TABLE IF NOT EXITS product (date text, item text, state text, ea real)") cur.execute("INSERT INTO product VALUES ('2022-05-30','CPU','SOLD',100)") product_list = [('2022-05-30','RAM','.. 2022. 5. 31.
PDF dark mode Sumatrapdf dark mode - https://www.sumatrapdfreader.org/download-free-pdf-viewer - https://www.sumatrapdfreader.org/dl/rel/SumatraPDF-3.3.3-64-install.exe Setting - Advanced Options MainWindowBackground = #000000 EscToExit = false ReuseInstance = false UseSysColors = false RestoreSession = true FixedPageUI [ TextColor = #eeeeee 2022. 4. 11.
PBS - Workload manager 작업 보내기 $ qsub job_script ${PBS_O_WORKDIR}/${PBS_JOBNAME}.${PBS_JOBID} https://docs.oracle.com/cd/E19957-01/820-0699/i999036/index.html 더보기 HOME – Home directory on execution machine USER – User ID of job owner JOB_ID – Current job ID JOB_NAME – Current job name; see the -N option HOSTNAME – Name of the execution host TASK_ID – Array job task index number SYNOPSIS qsub [-a date_time] [-A account_.. 2022. 3. 13.
[R] TCGAbiobanks Reference - https://bioc.ism.ac.jp/packages/3.4/bioc/vignettes/TCGAbiolinks/inst/doc/tcgaBiolinks.html - https://rpubs.com/tiagochst/LUAD_DNA_methylation_data 2022. 3. 10.
Markdown guide - https://www.markdownguide.org/basic-syntax/ Basic Syntax | Markdown Guide The Markdown elements outlined in the original design document. www.markdownguide.org - https://www.markdownguide.org/extended-syntax/ Extended Syntax | Markdown Guide Advanced features that build on the basic Markdown syntax. www.markdownguide.org - https://www.markdownguide.org/hacks/ Hacks | Markdown Guide Workarounds.. 2022. 3. 9.
Common ancestor 예전에 공통 부모를 찾는 문제를 풀어야 했던 적이 있다. 그 당시에는 주어진 데이터를 데이터화 하는 단계에서 단순한 띄어쓰기 문제로 제대로 풀지 못했는데, 그때가 생각나서 검색을 해보니 데이터화 해주는 패키지가 있었다. PRONTO - https://github.com/althonos/pronto - https://buildmedia.readthedocs.org/media/pdf/pronto/latest/pronto.pdf 문제) 두 샘플 아이디가 주어졌을 때, 가장 낮은 depth의 공통 부모를 찾아라. from pronto import Ontology import sys try: hp1 = sys.argv[1] hp2 = sys.argv[2] except: hp1 = 'HP:0001166' hp2 =.. 2022. 1. 24.
Methylcheck - https://life-epigenetics-methylcheck.readthedocs-hosted.com/en/latest/ - https://github.com/FoxoTech/methylcheck Before quality control 2022.01.19 - [Tools] - Methylprep 2022. 1. 20.

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