Fisher's exact test

Fisher's exact test
- for small samples

- categorical data

 

* Chi-squre test is for large samples. It means that it is an approximation of Fisher's exact test.

 

 

위와 같은 데이터가 있다고 하자. 구하고자 하는 것은 다음과 같다.

"전체 샘플18명에서 7명을 선택했을 때, case 8명 중에서 positive인 3명과 control 10명 중에 positive 4명을 선택할 확률은 얼마나 될 것인가?"

 

이런 경우 Fisher's exact test를 적용하게 된다.

Pr(K = 7) = ( 8c3 * 10c4 ) / 18c7

 

달리말해, Hypergeometric distribution에서 probability mass function을 구하는 것이다.

 

 

 

Reference

- https://en.wikipedia.org/wiki/Fisher%27s_exact_test

- https://en.wikipedia.org/wiki/Hypergeometric_distribution