집단유전학의 이론은 다음과 같이 나눌 수 있다.
1. Hardy-Weinberg principle
2. Wright-Fisher model (forward in time)
3. Coalescent model (backward in time)
1. Hardy-Weinberg principle
: Infinite population size에서 모집단의 대립유전자와 유전자형 빈도수는 다른 진화적 영향(evolutionary influences)이 없는 경우 세대에 따라 일정하게 유지될 것이다 (Mendelian inheritance). 여기서 가정이라고 할 수 있는 진화적 영향으로는 genetic drift, mate choice, assortative mating, natural selection, sexual selection, mutation, gene flow, meiotic drive, genetic hitchhiking, population bottleneck, founder effect, inbreeding이 있다.
2. Wright-Fisher model (Forward in time)
: Genetic drift의 수학적 model 중 하나이며, 몇 가지 가정이 있다.
- 세대는 overlap되지 않는다. (discrete generation)
- 다음 세대의 alleles는 현재 세대의 alleles가 random하게 선택되어 나타난다. (random mating, no selection)
- N diploid individuals in each generation. (finite population size)
3. Coalescent model (backward in time)
- 물리학에서 Coalescent란 단어 그대로 두 개 또는 그 이상의 물방울 또는 입자가 합쳐져 하나가 되는 과정을 이야기 한다. 아래 그림에서 Colalescence-Event로 표시한 부분이 backward in time에서 하나로 합쳐지는 event가 일어나는 지점이다. 좀 더 자세한 내용은 Coalescent theory를 참고하면 된다.
Reference
- http://www.incodom.kr/Population_genetics
- http://genetics.wustl.edu/bio5488/files/2016/03/Bio5488_PopGen_2016_Lecture1.pdf
- http://genetics.wustl.edu/bio5488/files/2016/03/Bio5488_PopGen_2016_Lecture2.pdf
- http://www.sfu.ca/biology/courses/bisc869/869_lectures/MHP_Coalescent.pdf
- http://ib.berkeley.edu/courses/ib200/2016/labs/11/coalescent_lecture.pdf
- https://cme.h-its.org/exelixis/web/teaching/seminarSlides/example2.pdf
- ko.wikipedia.org/wiki/하디-바인베르크_원리
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